누리온 UPPV3.1 설치 소개

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 UPPV3.1 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.

1. 설치 환경

구분	내용
대상 시스템	누리온
OS Version	리눅스 / CentOS 7.3
CPU	Intel(R) Xeon(R) Gold 6126
컴파일러	Intel 2018.3 Version
MPI	IntelMPI 2018.3 Version
기타	WRFV3.9.1.1

2. 설치 전 환경 설정

  누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 

  환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고,

  이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.

[ 환경 설정 ]

$ module load craype-x86-skylake intel/18.0.3 impi/18.0.3  $ module load hdf4/4.2.13 hdf5/1.10.2 netcdf/4.6.1 ncl/6.5.0  $ export JASPERLIB=/apps/common/jasper/1.900.29/lib  $ export JASPERINC=/apps/common/jasper/1.900.29/include

3. 설치 과정

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고,

 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.  

설치 과정

$ tar xvzf DTC_upp_v3.1.tar.gz $ cd UPPV3.1 $ ./configure   - - - - - [configure 과정 진행 내용] 참고 $ vi configure.upp  - - - - - [configure.upp 파일 수정 수정 내용] 참고 $ ./compile

※ UPP는 WRF 경로 설정을 별도로 하지 않기 위하여 아래와 같이 WRF와 동일 경로 상에 설치 하였다.

   만약 다른 경로에 WRF 가 있다면 WRF_DIR 설정이 필요함.

[configure 과정 진행 내용]

$ ./configure Will use NETCDF in dir:  /apps/compiler/intel/18.0.3/applib1/mic-knl/netcdf/4.6.1 Will use WRF in dir: /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/../WRFV3 configure: making ./bin bindir  /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/bin configure: making ./include incmod  /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/include configure: making ./lib libdir  /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/lib JASPER Environent found :: GRIB2 library :: grib2lib = -L/apps/common/jasper/1.900.29/lib -lpng -lz -ljasper grib2inc = -I/apps/common/jasper/1.900.29/include ------------------------------------------------------------------------- Please select from among the following supported platforms.    1.  Linux x86_64, PGI compiler  (serial)    2.  Linux x86_64, PGI compiler  (dmpar)    3.  Linux x86_64, Intel compiler (serial)    4.  Linux x86_64, Intel compiler (dmpar)    5.  Linux x86_64, Intel compiler, SGI MPT (serial)    6.  Linux x86_64, Intel compiler, SGI MPT (dmpar)    7.  Linux x86_64, gfortran compiler  (serial)    8.  Linux x86_64, gfortran compiler  (dmpar)    9.  Linux x86_64, Intel compiler, IBM POE (serial)   10.  Linux x86_64, Intel compiler, IBM POE (dmpar)   11.  Linux x86_64, gfortran compiler: -f90=gfortran  (serial)   12.  Linux x86_64, gfortran compiler: -f90=gfortran  (dmpar)   13.  Linux x86_64, PGI compiler: -f90=pgf90  (serial)   14.  Linux x86_64, PGI compiler: -f90=pgf90  (dmpar) Enter selection [1-14] : 4 ------------------------------------------------------------------------- Configuration successful. To build the UPP, type: compile  -------------------------------------------------------------------------

[configure.upp 파일 수정 수정 내용]

DM_FC  = mpiifort DM_F90 = mpiifort -free DM_CC  = mpiicc   FOPT    = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512 CRTMOPT = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512 COPT    = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512   GRIB2SUPT_LIB   =    -L/apps/common/jasper/1.900.29/lib -L/apps/common/libpng/1.2.56/lib -lpng -lz -ljasper GRIB2SUPT_INC   =    -I/apps/common/jasper/1.900.29/include -I/apps/common/libpng/1.2.56/include

※ 누리온 시스템 설치 예제는 SKL/KNL 계산노드에서 공통적으로 사용을 위해 "-xCOMMON-AVX512" 로 작성

 - SKL(skylake) 노드 전용 : -xCORE-AVX512

 - KNL(Intel Xeon Phi Knights Landing) 전용 : -xMIC-AVX512

 - SKL 과 KNL 공통 적용 : -xCOMMON-AVX512

 - 참고 :  https://software.intel.com/en-us/articles/compiling-for-the-intel-xeon-phi-processor-and-the-intel-avx-512-isa